疫苗也是一种商品，因此即使是针对同一种疾病的疫苗也有多种可选。目前国家要求接种的为一类疫苗，皆免费，但在打疫苗时也有医院会推荐“自费”疫苗，需额外收费，但价格尚可接受。二类疫苗都是收费，价格略高。疫苗的一、二分类是根据我国国情和各地财政状况划分的，在疾病预防方面并无优劣之分，两者同样重要。
上面提到一类疫苗中的“自费”疫苗，如果医院推荐的话，要问清楚收费和免费的区别，如果是国产和进口的区别，选国产，经研究表明国产疫苗相对进口的更符合国人体质。但如果是减毒和灭活的区别，建议选择灭活收费的，相对减毒疫苗，灭毒疫苗更安全，孩子出现不良反应的几率大大降低。
二类疫苗中也有国产和进口之分，但大多是进口疫苗。虽然二类疫苗不是国家规定强制接种，但二类疫苗是对一类疫苗的补充，接种二类疫苗孩子可获得更广泛的保护，有条件的家庭推荐接种。
医生建议优先接种的自费疫苗有这几种：HIB疫苗、肺炎13价疫苗、水痘疫苗、流感疫苗、口服轮状病毒疫苗。其中HIB疫苗，全称B型流感嗜血杆菌疫苗，这种流感嗜血杆菌可引起婴儿严重疾病甚至死亡，故而世界上很多发达国家将它计入常规计划疫苗。
近几年较流行的五联疫苗和四联疫苗中就包含HIB疫苗，五联疫苗为进口，包括灭活脊灰-百白破-Hib疫苗，四联则是国产疫苗，内含百白破-Hib疫苗。百白破（百日咳、破伤风、白喉）疫苗和脊灰疫苗在一类疫苗中已包含，选择联合疫苗后医院会自行更换。联合疫苗的优点是包含的疫苗种类多，接种次数少，能减少孩子打针的痛苦。
单独打HIB疫苗的收费大概是60-200元（国产和进口价格的区别），四联疫苗的价格在300-600元，而进口五联疫苗则需3千元左右。
